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Construyeron el mayor árbol genealógico de la historia
El estudio a cargo de un equipo de investigación de la Universidad de Oxford podría ser especialmente beneficioso para la genética médica
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Un equipo de la Universidad de Oxford logró construir el mayor árbol genealógico de la historia sobre la diversidad genética humana, que revela la relación de individuos de todo el mundo y permite conocer los principales acontecimientos de la historia de la humanidad, su cronología y localización geográfica.
Esta nueva red genealógica que predice los antepasados comunes, recupera acontecimientos claves, como por ejemplo, la migración humana fuera de África y se consiguió gracias a un nuevo método no paramétrico que combina datos de registro en árbol de genomas humanos antiguos y modernos, que fue publicado en la revista Science.
“Básicamente hemos construido un enorme árbol genealógico, una genealogía para toda la Humanidad, que modela con la mayor exactitud posible la historia que generó toda la variación genética que encontramos en los seres humanos hoy en día”, explicó Yan Wong, del Big Data Institute de la Universidad de Oxford y uno de los autores del informe.
Esta genealogía permite ver -explicó- cómo la secuencia genética de cada persona se relaciona con todas las demás, a lo largo de todos los puntos del genoma. El estudio integró datos sobre genomas humanos modernos y antiguos de ocho bases de datos e incluyó 3609 secuencias genómicas individuales de 215 poblaciones. Dentro de los genomas antiguos se incluyeron muestras encontradas a lo largo de todo el mundo con edades comprendidas entre los 1.000 y 100.000 años.
Los algoritmos predijeron dónde debían estar presentes los ancestros comunes en los árboles evolutivos para explicar los patrones de variación genética y la red resultante contenía casi 27 millones de ancestros. En las últimas décadas se generaron datos genómicos de cientos de miles de personas, entre ellas miles prehistóricas, lo que plantea la posibilidad de rastrear los orígenes de la diversidad genética, pero el gran reto era combinar las secuencias genómicas de muchas bases de datos y desarrollar algoritmos capaces de manejar la gran cantidad de datos.
Los investigadores de Oxford usaron un nuevo método que era capaz de combinar fácilmente los datos de múltiples fuentes y escalar para dar cabida a millones de secuencias genómicas.
Wong se refirió al respecto en declaraciones con la agencia SINC, donde explicó: “Un método no paramétrico significa que tuvimos que hacer muy pocas suposiciones sobre la naturaleza de las migraciones humanas. Por ejemplo, no necesitamos conjeturar si hubo una, o solo unas pocas migraciones fuera de África. (...) Nuestro objetivo es dejar que los datos hablen por sí mismos”.
El autor principal del estudio, Anthony Wilder, señaló que se reconstruyen los genomas de nuestros antepasados, y se utilizan para formar una vasta red de relaciones, tras lo que se puede estimar cuándo y dónde vivieron estos.
De esta forma, el conjunto de árboles, conocido como “secuencia arbórea” o “gráfica de recombinación ancestral”, enlaza las regiones genéticas a través del tiempo con los ancestros en los que la variación genética apareció por primera vez.
Wong consideró que este estudio sienta la bases para la próxima generación de secuenciación de ADN, que permita hacer árboles cada vez más precisos hasta llegar a un mapa único y unificado que explique la descendencia de toda la variación genética humana que hay hoy en día. El equipo de investigación de momento tiene previsto seguir enriqueciendo el mapa genealógico a medida que surjan más datos genéticos.
La actual investigación se centra en los humanos, pero el método empleado es válido para la mayoría de los seres vivos y podría ser “especialmente beneficioso para la genética médica, al separar las verdaderas asociaciones entre las regiones genéticas y las enfermedades de las conexiones falsas derivadas de nuestra historia ancestral compartida”.
Tipo de trabajo:review
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