El xeneize debutará en la Fase 2 de las etapas preliminares vs. Alianza Lima de Perú o Nacional de Paraguay; si avanza, chocará con Deportes Iquique o Independiente Santa Fe
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Boca Juniors es uno de los equipos que deberá superar un repechaje para obtener uno de los cuatro cupos vacantes para la Copa Libertadores 2025. El xeneize tiene que atravesar dos llaves de eliminación directa, las denominadas Fases 2 y 3, para ingresar a las zonas. En la instancia 2 su oponente será el que se imponga de la serie de la Fase 1 entre Alianza Lima (Perú) o Nacional (Paraguay). La ida se jugará la semana del 19 de febrero y la vuelta, la siguiente en la Bombonera.
En la Fase 3 el equipo de la Ribera puede cruzarse con Independiente Santa Fe (Colombia) o Deportes Iquique (Chile) y, en el caso de quedar eliminado en esa instancia, pasará a la Copa Sudamericana 2025. Boca definirá todas las series del repechaje como local porque tiene mejor ubicación en el ranking de la Conmebol que todos los demás clubes que están en las rondas preliminares.

Cuadro de la Fase Preliminar de la Copa Libertadores 2025
Fase 1 (semanas del 7 y 14 de febrero)
- El Nacional (Ecuador) vs. Representante de Bolivia.
- Alianza Lima (Perú) vs. Nacional (Paraguay).
- Defensor Sporting (Uruguay) vs. Monagas (Venezuela).
*Los tres ganadores de las series avanzarán a la Fase 2.
Fase 2 (semanas del 21 y 28 de febrero)
- Independiente Santa Fe (Colombia) vs. Deportes Iquique (Chile).
- Bahía (Brasil) vs. Representante de Bolivia.
- Cerro Porteño (Paraguay) vs. Defensor Sporting (Uruguay) o Monagas (Venezuela).
- Barcelona (Ecuador) vs. El Nacional (Ecuador) o Representante de Bolivia.
- Corinthians (Brasil) vs. Universidad Central (Venezuela).
- Melgar (Perú) vs. Representante de Colombia.
- Ñublense (Chile) vs. Boston River (Uruguay).
- Boca Juniors vs. Alianza Lima (Perú) o Nacional (Paraguay).
*Los ganadores de cada uno de los cruces avanzarán a Fase 3.
Fase 3 (semanas del 6 y 13 de marzo)
- Ganador del cruce 1 vs. Ganador del cruce 8.
- Ganador del cruce 2 vs. Ganador del cruce 7.
- Ganador del cruce 3 vs. Ganador del cruce 6.
- Ganador del cruce 4 vs. Ganador del cruce 5.
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— CONMEBOL Libertadores (@Libertadores) December 19, 2024
Boca Juniors entró a la Copa Libertadores 2025 con el cupo de ‘Argentina 6′, es decir con el último boleto que se liberó por la consagración de Vélez en la Liga Profesional 2024. Salió favorecido gracias a que Racing fue campeón de la Copa Sudamericana 2024 e ingresó al máximo campeonato continental por esa conquista más allá de que terminó por encima suyo en la Tabla Anual, es decir, liberó un cupo que quedó en manos del xeneize.
En caso de ser uno de los cuatro clasificados a la etapa de grupos, el segundo máximo campeón de la historia del torneo, con seis estrellas, una menos que Independiente, integrará el Bombo 4 en el sorteo y no tendrá impedimentos con respecto a los enfrentamientos, por lo que podría jugar con River o con cualquier otro equipo argentino (Vélez, Estudiantes, Racing, Central Córdoba o Talleres).
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